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定量蛋白组学分析

定量蛋白组学分析

标记定量
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标记定量基本原理利用不同稳定同位素标记不同样品中的肽段，等量混合后质谱检测。通过比较不同稳定同位素标记肽段间的质量差对不同样品中的肽段及蛋白进行相对定量。 技术路线结果示例差异蛋白筛选基于不同筛选标准，筛选样品间定量差异显著的蛋白。统计各比较组间差异蛋白总数及不同显著性的差异蛋白数量。差异蛋白列表展示筛选出的差异蛋白定量比值及其差异显著性聚类分析热图及趋势图展示差异蛋白聚类热图及各类别蛋白定量趋势。注释及富集分析展示差异蛋白注释信息及其中显著富集的注释条目。 蛋白互作网络展示差异蛋白间已知及推测存在的蛋白相互作用适用项目差异蛋白筛选病毒宿主相互作用疾病标志物筛选生理病理机制探索激酶底物筛选鉴定
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SWATH定量
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SWATH定量基本原理通过传统DDA质谱检测模式建立谱图数据库后，采用SWATH质谱检测模式，全面提取二级谱图中的碎片离子定量信息，对各个鉴定到的肽段及蛋白进行相对定量。技术路线   结果示例定量数据总览展示所有定量蛋白的定量信息热图   差异蛋白筛选基于不同筛选标准，筛选样品间定量差异显著的蛋白。   差异蛋白统计概览统计各比较组间差异蛋白总数及不同显著性的差异蛋白数量。   差异蛋白列表展示筛选出的差异蛋白定量比值及其差异显著性   聚类分析热图及趋势图展示差异蛋白聚类热图及各类别蛋白定量趋势。  注释及富集分析展示差异蛋白注释信息及其中显著富集的注释条目。   蛋白互作网络展示差异蛋白间已知及推测存在的蛋白相互作用  适用项目差异蛋白筛选疾病生物标志物筛选
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非标记定量
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非标记定量基本原理基于各肽段一级谱图的检测信号强度，归一化处理后对其对应蛋白进行相对定量。技术路线  结果示例定量数据总览展示所有定量蛋白的定量信息热图  差异蛋白筛选基于不同筛选标准，筛选样品间定量差异显著的蛋白。  差异蛋白统计概览统计各比较组间差异蛋白总数及不同显著性的差异蛋白数量。  差异蛋白列表展示筛选出的差异蛋白定量比值及其差异显著性聚类分析热图及趋势图展示差异蛋白聚类热图及各类别蛋白定量趋势。  注释及富集分析展示差异蛋白注释信息及其中显著富集的注释条目。  蛋白互作网络展示差异蛋白间已知及推测存在的蛋白相互作用  适用项目差异蛋白筛选互作蛋白筛选病毒与宿主相互作用疾病生物标志物筛选生理病理机制探索
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PRM靶向定量
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PRM靶向定量基本原理通过传统DDA质谱检测模式，选定目标蛋白特定的靶标离子，通过PRM靶向检测选定的靶标离子，从而对目标蛋白进行精确定量。技术路线  结果示例适用项目蛋白绝对定量质谱定量数据验证
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